磁力泵的磁損主要表現為金屬隔離套處的熱量積聚而導致溫度的升高，為了消散熱量及避免所輸送液體在磁轉子處汽化，必須要有一定的冷卻流量給它降溫。另外，由于磁力泵中的軸承為滑動軸承（碳化硅），碳化硅滑動軸承正常工作時需要穩定的液流形成一個液膜，這個液膜的形成需要磁力端提供的合適的溫度和壓力，因此滑動軸承也需要一定的冷卻潤滑量。

磁力泵需要一個比較科學的內循環來保證磁力泵的安全平穩的運行，下面介紹幾類常規結構的內循環方式：

第一類：高進低出 

A：冷卻介質由葉輪出口進入，分兩路流回低壓區。主流冷卻介質流經內轉子與隔離套間隙、軸心孔回到葉輪入口；另一小部分介質流經滑動軸承經葉輪平衡孔回到低壓區。這種循環方式為國內磁力泵內循環的常規循環方式。

 B：冷卻介質從葉輪出口進入，分兩路流回低壓區。主流冷卻介質流經內轉子與隔離套間隙、軸心孔、經葉輪平衡孔回到低壓區；另一小部分介質流經滑動軸承，經葉輪平衡孔回到低壓區。這種循環方式兼顧效率與介質特性，考慮比較全面，為磁力泵內循環的優選方案。

第二類：高進高出

 A：冷卻介質從葉輪出口進入，分兩路流回高壓區。主流冷卻介質由軸心孔進入，經內轉子輔助葉輪加壓，流經內轉子與隔離套間隙至葉輪出口；另一小部分介質流經滑動軸承后由平衡口進入葉輪。

 B：冷卻介質從葉輪出口進入，分兩路流回高壓區。主流冷卻介質從葉輪出口、流經內轉子與隔離套間隙，經葉輪背葉片加壓輸出至葉輪出口；另一小部分介質流經滑動軸承后由葉輪背葉片加壓到葉輪出口。

第三類：循環方式   

也稱為逆循環方式，作為易汽化介質的內循環方案，由于增加了輔助葉輪也使磁力泵的整體效率有所下降。